หลักการทำงานของปั๊มโคลนขึ้นอยู่กับการเปลี่ยนแปลงปริมาตรห้องทำงานเป็นระยะ ซึ่งจะแปลงพลังงานกลของผู้เสนอญัตติหลักเป็นพลังงานความดันของของเหลวที่ลำเลียงโดยตรง อัตราการไหลของปั๊มส่วนใหญ่ได้รับผลกระทบจากค่าการเปลี่ยนแปลงของปริมาตรห้องทำงานและความถี่ของปั๊ม และไม่มีความสัมพันธ์โดยตรงกับแรงดันปล่อย ปั๊มโคลนตระหนักถึงการเปลี่ยนแปลงปริมาตรห้องทำงานเป็นระยะโดยผ่านการเคลื่อนที่แบบลูกสูบของลูกสูบในห้องทำงานของกระบอกสูบ โครงสร้างของมันแยกจากโลกภายนอกด้วยอุปกรณ์ปิดผนึก และสื่อสารหรือปิดกับท่อผ่านวาล์วปั๊ม
